Вы можете въехать и активировать визу в октябре, как и хотели, но чтобы уехать на целые два года, вам нужно будет оформить re-entry permit. Можно конечно летать и "отмечаться" (просто штампы в паспорте, ни в какие инстанции ходить не надо ), как вы говорите. Но подумайте, надо ли вам это обучение в Японии after all ведь это задержит вашу адаптацию, поиск работы в Штатах и так далее ещё на два года. Может сразу в Штаты и на месте ориентироваться?